EDS初装后，若需要对原涉密文件进行加密，可通过EDS扫描加密功能达到目的。

若由于某种原因，涉密机器要转成非涉密机使用，可通过EDS扫描解密功能将所有加密过的文件进行解密。EDS还提供扫描解密涉密类型之外的密文功能，以清除过度加密的文件。

EDS扫描功能可通过三种方式实现。分别是：

1. 通过服务端用户管理里设置扫描任务；

2. 通过工具扫描加密；

3. 通过客户端扫描工具扫描加密；

服务端扫描功能可一次对多个用户执行。